مسجد شیخ لطف‌الله اردیبهشت ۱۳۵۸به عنوان بخشی از میدان نقش جهان اصفهان در فهرست میراث جهانی یونسکو ثبت شد. هرچند در طول سال‌های بعد بخش‌های مختلف این مجموعه جهانی با خطراتی مواجه شد، اما می‌توان روند مرمت گنبد این مسجد را یکی از مهمترین آسیب‌های واردشده به این مجموعه تاریخی جهانی دانست. خبر دورنگ شدن گنبد مسجد در حین مرمت در سال ۹۸ و اتهام‌زنی میراث فرهنگی مبنی بر فتوشاپی بودنِ تصاویر، نگاه‌ها را بیش از پیش متوجه گنبد این بنا کرد. کار متوقف و قرار شد پیمانکار پروژه تغییر کند؛ اما بعد از گذشت بیش از یک سال، پیمانکار سابق، کار مرمت گنبد را آغاز کرد و حالا صدای اعتراض‌ها به این اقدام بلند شده است.